Я, конечно, не спецалист в зоопсихологии и вообще технарь, но у меня есть свое мнение.
По-моему, кошки большую часть времени осознают свои действия и могут вести себя вполне разумно, но в определенных ситуациях инстинкты берут верх над их волей и заставляют вести себя так, как в них с рождения заложено. Например, играющая кошка может вцепиться хозяину в руку, но спустя короткое время ей самой станет очень стыдно и она отпустит. Да и вообще, кошки хорошо понимают, что мячики или шнурки - это никакая не живая и не съедобная добыча, но их все равно сильно тянет к подобному.
И исходя из этого, можно предположить, что кошки, скребущие по голому линолеуму прекрасно осознают абсурдность своих действий, но ничего не могут с собой поделать.
Кстати, еще одно наблюдение - обычно мимо лотка ходят нервные или напуганные кошки. Возможно, это связано с тем, что в у них в таком состоянии усиливается роль инстинктов, а выбор одного и того же места для туалета — это уже работа разума. В принципе, данную теорию можно проверить, узнав — ходят ли дикие кошки в одно и то же место, как домашние, или в разные.