>>612339
Команду никто у тебя не покинет по своей воле в принципе в МЭ2, как максимум грозит нелояльность. Исключений из правила два - миссия на лояльность Самары, но это опционально, доступно только для очень-очень злых и замена Самары всё равно будет предоставлена в таком случае и миссия на лояльность Заида, если ты по какой-то причине отложишь его личное задание на постфинал - но опять же, только как опция, и только на парагоновской ветке прохождения той миссии, если правильно помню.
Нелояльность также может потенциально обернуться проблемами на финальной миссии (если не знать некоторые тонкости механики финальной миссии) и может потенциально повлиять на некоторые события в МЭ3.
В описанном же тобой случае после завершения миссии Джек между ними двумя будет конфликт на борту Нормандии; но это привязано к тому, что обе - и Миранда, и Джек - получат лояльность, а не к завершению конкретной миссии. Конфликт можно разрешить на месте, если достаточно очков парагона или ренегата - в противном случае придется принять чью-то сторону, и тот, чью сторону не приняли, потеряет лояльность. Впрочем, насколько я знаю, потом можно вернуть лояльность "проигравшего" в персональном разговоре - лично мне таким не приходилось заниматься.
Подобный конфликт с теми же правилами также возникнет ближе к концу игры (персонажа-спойлер раньше не получить) между Тали и Легионом, и там уже лучше иметь максимум в парагоне или ренегате, если хочется убедить на месте.